Wir schreiben das Jahr 2029. Mechanisch augmentierte Menschen leben als Ausgestoßene völlig abseits der restlichen Gesellschaft.
Adam Jensen, ein erfahrener Geheimagent, ist gezwungen, in einer Welt zu arbeiten, die seinesgleichen verabscheut. Mit modernsten Waffen und Augmentierungen ausgerüstet muss er wählen, wie er vorgeht, um eine weltweite Verschwörung aufzudecken, und wem er dabei trauen kann.